Sau thành công của phần 1, Vua Khỉ Tái Xuất đã chính thức được cống chiếu mùa thứ hai, với những nội dụng và cốt truyện sẽ là câu chuyện nối tiếp những gì còn dang dở ở phần đầu tiên của bộ phim. Phim Vua Khỉ Tái Xuất Phần 2 là câu chuyện được lấy bối cảnh vào những năm 2050, khi đó nhân vật Kông nổi lên là một quái thú hung tàn và độc ác, con người luôn cảm thấy khiếp sợ về những gì mà Kong đã làm, và chính Kong đang trở thành một kẻ chạy trốn truy nã sau khi phá hoại tàn phá tại Alcatraz của Đảo Lịch sử Tự nhiên và Marine Preserve.
Câu chuyện về Vua Khỉ Tái Xuất lại không hề như những gì mà người dân đang cảm nhận được, sự thật sau âm mưu buộc tội Kong trở thành một một kẻ truy lã đang bị một tổ chức ngầm đứng đằng sau với những âm mưu và thủ đoạn vô cùng đáng sợ mà không hề ai hay biết về những sự thật đang diễn ra tại thành phố. Phim Vua Khỉ Tái Xuất Phần 2 cũng chính Kong sau này sẽ là nhân vật cứu giúp nhân loại khỏi sự hủy diệt, chúng đã lợi dụng công nghệ và khoa học để đưa những con khủng long tàn bạo và lũ robot đáng sợ vào công cuộc chinh phạt thế giới.
Vua Khỉ Tái Xuất Phần 2 cũng là câu chuyện xoay quanh nhân vật nam chính anh là Lukas Remy, một người luôn có lòng đam mê vô tận đối với động vật hoang dã, Lukas anh cũng chính là người con trai của bác sĩ Leo Remy và anh trai sinh đôi của Richard. Luka luôn yêu và quan tâm đến động vật, đặc biệt anh có một mối quan hệ mật thiết và gần gũi nhất với Kong (một loài quái thú mà luôn bị người đời kì thị). Anh cũng chính là người đầu tiên đứng lên phản đối kế hoạch độc ác của anh trai mình, cùng với sự giúp đỡ của Kong và bạn bè anh, Lukas đã và đang làm những tất cả những gì để giúp đỡ được Kong và cứu thoát thế giới khỏi những âm mưu tàn bạo.