Cốt truyện trong bộ phim hoạt hình Ghost in the Shell: Stand Alone Complex – The Laughing Man được lấy bối cảnh trong tương lai, khi đó công nghệ khoa học phát triển mạnh mẽ, giúp cho một cơ thể hoàn chỉnh được tạo ra bằng công nghệ Cybord hóa, da thịt cấy ghép với máy móc, giúp tăng cường sức mạnh một cách hoàn hảo. Tuy nhiên có một sự thật là, phe thiện và phe ác đều sở hữu những công nghệ tân tiến đó, khiến cuộc chiến giữa 2 phần thế giới càng trở nên khốc liệt.
Vỏ Bọc Ma: Mặt Cười kể về thời điểm tại Nhật Bản, Đội 9 khi đó xuất hiện một lực lượng hoạt động hoàn toàn độc lập và tồn tại một cách không danh chính ngôn thuận do Daisuke Aramaki và Motoko Kusanag dẫn dắt, được thành lập. Họ chính là những người hùng thầm nặng sẵn sàng hi sinh tính mạng để bảo vệ người dân và diệt trừ cái ác.
Trong phần này, họ bị cuốn vào vụ án mang tên Người đàn ông Cười – rất nhiều ẩn số, khúc mắc sẽ dần được hé lộ… Người đàn ông đó là ai ? những vụ giết người hàng loạt có liên quan gì đến ông ta không? Mời các bạn đón xem bộ Phim Ghost in the Shell: Stand Alone Complex – The Laughing Man để theo dõi nhé.