Mật danh iris 2 là phần tiếp theo của bộ phim iris 1 năm 2009 và 2010 với dàn diễn viên khá mới mẻ . Câu chuyện xảy ra ba năm sau cái chết của Hyun Joon sẽ tiết lộ bí ẩn xung quanh cái chết của anh và Baek San, người đã bị bắt vì hoạt động trong tổ chức bí mật IRIS. Phần 2 đồng thời sẽ hé lộ về người đàn ông giấu mặt – Mister Black, thủ lĩnh điều khiển tất cả mọi thứ thông qua Baek San. Các diễn viên trong phần phim thứ 2 là những gương mặt nổi tiếng như Jang Hyuk, Lee Bum Soo, đặc biệt là “mỹ nhân dao kéo” Lee Da Hae “lột xác” thành đả nữ.
Bắt đầu là 3 năm sau cái chết của mật vụ NIS (Vụ tình báo quốc gia) Kim Hyeon Jun (Lee Byung Hun) gây ra do nhóm khủng bố IRIS. Tại một nhà kho nơi bán vũ khí trái phép, đội trưởng NSS (Vụ an ninh quốc gia) Joon Han (Sung Dong Il) gặp thám tử Yoo Gun (Jang Hyuk) và đề nghị được làm việc cùng anh như một mật vụ của NSS. Sau đó, Yoo Gun trở thành đội trưởng đội TF-A của NSS. Soo Yeon (Lee Da Hae), người đã yêu Yoo Gun từ khi họ còn nhỏ, cũng bắt đầu làm việc với tư cách mật vụ NSS. Choi Min (Oh Yeon Su) mới được bổ nhiệm làm phó giám đốc NSS. Mục đích duy nhất của bà là loại trừ IRIS.
Cựu giám đốc NSS Baek San (Kim Young Chul) đang bị tống giam tại nhà tù NSS, trên một hòn đảo xa bờ. Một chiếc trực thăng yêu cầu được hạ cánh trên đảo và tự xưng là mật vụ của NSS. Sau khi hạ cánh, chúng bất ngờ tấn công những mật vụ của NSS. Thực ra đó là những thành viên của IRIS. Được chỉ đạo bởi Ray (David McInnis), chúng cứu thoát Baek San khỏi nhà tù. Nhưng khi trực thăng rời đảo, Baek San đã nhảy ra khỏi trực thăng và rơi xuống biển.
Yoo Gun, Soo Yeon và Huyn Woo (Yoon Doo Joon) đến đảo. Soo Yeon bị Baek San bắt giữ và dùng một khẩu súng khống chế cô. Yoo Gun cố gắng kéo dài thời gian với Baek San, nhưng từ xa Hyun Woo đã bắn vào Baek San. Soo Yeon bị trúng đạn và được đưa tới bệnh viện.