Sau thành công của phần 2 trong seri phim kinh dị Hàm Cá Mập, khán giả đã phải chờ đợi tới 5 năm để có thể được xem tiếp Hàm Cá Mập 3 và phần này tiếp tục được nhà sản xuất chi ra 20 triệu USD cho việc sản xuất. Dựa theo tiểu thuyết cùng tên của nhà văn Peter Benchley, đạo diễn cho phần 3 là cái tên khác với 2 phần trước – Joe Alves, trong khi dàn diễn viên có nhiều sự thay đổi, đó là một trong những nguyên do khiến phần này không thành công được như 2 phần trước , phim không được đánh giá cao về mặt chất lượng dù nó vẫn thành công về mặt thương mại.
Hàm Cá Mập 3 bắt đầu từ vài năm sau khi cựu cảnh sát trưởng của Amity Martin Brody tiêu diệt được con cá mập hung hãn, con trai của ông là Mike và Sean, hiện đang làm việc trong các vai trò khác nhau tại Sea World Orlando. Mike đang là một kỹ sư trong công viên và anh dự định sẽ sớm kết hôn với bạn gái của mình, nhà sinh vật học cá voi Kathryn Morgan. Sean cũng tham gia với 1 người trượt tuyết của công viên, Kelly Ann Bukowski. Sea World sắp mở một “Vương quốc dưới biển” với quy mô đồ sộ, hứa hẹn sẽ đưa du khách đến gần với sinh vật biển hơn bao giờ hết. Du khách có thể tới công viên từ đại dương bằng một loạt các cổng, nhưng một trong số đó bị trục trặc.
Một con cá mập trắng lớn bơi qua cổng và khi một thợ lặn bảo trì đi xuống để sửa cổng thì anh ta không quay lại, trong khi một con cá voi trắng bị tấn công, dù nó đã được đưa lên và Kathryn cố gắng hết sức để cứu nhưng đã không thành công. Đáng báo động hơn, là con cá mập khổng lồ, cao 35 feet, đã theo con cá mập con vào đầm phá và giết chết thợ lặn bảo trì, thi thể đã được tìm thấy. Không lâu sau khi con cá mập khổng lồ bắt đầu tàn phá, và Mike và Kathryn, cùng với quản lý của Sea World là Calvin Bouchard và nhiếp ảnh gia Phillip Fitzroyce, phải tìm cách tiêu diệt những con cá mập trước khi họ hoặc những du khách trở thành bữa ăn tiếp theo của chúng.