Tiếp nối câu chuyện của phần 1, nội dung của phim Bàn Tay Nhân Ái 2 bắt đầu từ bác sĩ láu cá Henry (Lâm Bảo Di), anh vẫn đang rất hạnh phúc cùng cô bạn gái luật sư thông minh và trầm tính Annie (Trần Tuệ San), tuy nhiên họ vẫn chưa sẵn sàng cho việc dọn về sống chung một nhà. Mặt khác, anh trai của Annie là Gilbert (William So), đã qua đời bởi căn bệnh Aids. Một vài tháng trước khi anh ta qua đời, anh đã mang một con chó con trên đường phố về nhà để chăm sóc. Peter Cheung (Trương Gia Huy) và Cheung Suk-Yan (Angela Tong) thì đã kết hôn ở Anh và 2 người hiện có một cuộc sống rất ổn định.
Một cặp vợ chồng khác là Joe Cheung (Steven Ma) và Helen Ling (Astrid Chan) thì đang làm việc trong một ngôi làng xa xôi ở châu Phi. Mặc dù thời gian đã mang đi khá nhiều những bác sĩ tận tâm của bệnh viên, nhưng ở đó vẫn còn có Paul Ching (Ngô Khải Hoa), anh vẫn cống hiến hết sức tài năng cho công việc của mình và giữ phương châm cuộc sống của anh để cứu bệnh nhân khỏi cái chết. Anh cũng vẫn đang chờ bạn gái của mình – Jackie Tong (Thái Thiếu Phân) thức dậy sau hai năm nằm hôn mê.
Trong khi đó, dưới sự quản lý của Steven (Joe Cheung), chủ tịch bệnh viện, mọi thứ trong bệnh viện ngày ngày đều diễn ra một cách suôn sẻ và yên bình. Sự bình an như vậy cuối cùng cũng đã bị thách thức vì có sự hiện diện của ba bác sĩ trẻ tuổi và tài năng tới làm việc trong bệnh viên. Khi họ đến bệnh viện, họ không chỉ mang lại tiếng cười và động lực mới vào nhóm, mà còn giúp mọi người trong viện hiểu rõ hơn về cuộc sống.